南京玄武门并非明代原建城门，而是晚清时期为举办南洋劝业会开辟的新门，原名丰润门，1928 年正式更名为玄武门，门额由蔡元培题写，是南京明城墙中唯一一座一门跨四朝代的城门 。
清光绪三十四年（1908 年），两江总督端方为举办南洋劝业会，奏请在明城墙开辟新门以方便游览玄武湖，工程由继任总督张人骏完成，于宣统二年（1910 年）落成。因张人骏籍贯河北丰润，初命名为"丰润门"，其开辟标志着玄武湖正式成为近代意义上的公园 。
南洋劝业会是清政府于1910 年在南京首次以官方名义主办的国际性博览会，被视为中国近代化进程中的重要里程碑 。1928 年（民国十七年），国民政府整顿城门名称，去除封建色彩，将丰润门改名为"玄武门"，取意“玄武湖泽被民生，玄武门名副其实”。
1934 年，为适应交通需求及美观，在原门两侧添辟左右券门，改建为三孔券门。1984 年，为庆祝中华人民共和国成立 35 周年，在城门上方加建城楼，形成现今模样 。2025 年 8 月，历时 10 个月的解放门 - 玄武门段城墙修缮工程完工，对墙体、城楼及门券结构进行了加固，恢复了明代雉堞女墙结构 。
