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人类SARS-CoV-2进化,酿酒酵母中麦角固醇生物合成,组蛋白去乙酰化酶等|Genes 高引文章推荐

作者:本站编辑      2023-01-11 18:17:30     41
本文来自“MDPI开放科学”,文章仅代表作者观点,与“科研圈”无关。

Genes (ISSN 2073-4425) 是一个国际性的、经同行评审的遗传学开放获取期刊,由 MDPI 以月刊形式在线出版。其创刊于 2010 年,期刊设有 18 个专题。根据 2022 年 6 月最新发布的 Journal Citation Reports (JCR),Genes  期刊 2021 年影响因子为 4.141,5 年影响因子为 4.474,在 JCR 的遗传学 (Genetics &Heredity) 分区中处于二区。目前已被 Science Citation Index Expanded (Web of Science)、PubMed、Scopus 等数据库收录。十年来,期刊稳步发展,不断壮大,得到了国内外学者的高度认可和支持。

本期编辑荐读精选了 Genes 期刊上发表的 5 篇高引文章,内容包括组蛋白去乙酰化酶的研究进展与医学应用、辐射与成簇 DNA 双链断裂的生物学效应与临床应用、假单胞菌属分类学中的基因组学研究、酿酒酵母中麦角固醇生物合成的调控和人类 SARS-CoV-2 进化等热门话题。希望能为相关领域学者提供新的思路和参考,欢迎阅读。

01

Regulation of Ergosterol Biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae

酿酒酵母麦角甾醇生物合成的调控

Tania Jordá and Sergi Puig

https://www.mdpi.com/2073-4425/11/7/795

当前引用:98

文章亮点:

(1) 麦角甾醇合成调节通过重叠机制实现,包括转录表达、酶的反馈抑制及其亚细胞定位的变化。

(2) 麦角甾醇生物合成变化导致多效性缺陷,限制细胞增殖和对应激的适应,由于 ERG 基因数量众多,麦角甾醇调控在许多方面有待进一步研究。

(3) 麦角甾醇生物合成途径是健康和农业中抗真菌剂的主要靶点之一,该物质合成和运输的分子机制对设计新的抗真菌策略至关重要。

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02

Histone Deacetylases (HDACs): Evolution, Specificity, Role in Transcriptional Complexes, and Pharmacological Actionability

组蛋白去乙酰酶:进化、特异性及其在转录复合物中的作用与药理作用

Giorgio Milazzo et al.

https://www.mdpi.com/2073-4425/11/5/556

当前引用:91

文章亮点:

(1) 总结了在不同情况下锌依赖的组蛋白去乙酰酶 (Histone Deacetylases, HDAC) 的最新研究认识,HDAC 基因数量与生物体的复杂性成正比,只有较高的真核生物才拥有 11 个HDAC。

(2) 重点关注 HDAC 抑制剂作为抗癌剂的作用,以及不同 HDAC 的化学特异性。 

(3) 讨论了 HDAC 作为染色质结合和调节复合物在人类相互作用组中的作用。

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阅读英文原文。

03

Genomics in Bacterial Taxonomy: Impact on the Genus Pseudomonas

细菌分类学中的基因组学:对假单胞菌属的影响

Jorge Lalucat et al.

https://www.mdpi.com/2073-4425/11/2/139

当前引用:89

文章亮点:

(1) 目前假单胞菌属中的几个物种命名是同义的,且必须在单个基因组物种中进一步进行完整的分类学分析重组。

(2) 已知物种的许多菌株可以根据 16S rDNA 序列进一步分析其物种类型,并提议作为属内的新基因组物种。

(3) 由 4、100 和 120 个基因序列多位点序列分析定义的主要系统发育组与全基因组分析中的分组一致。

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阅读英文原文。

04

Clustered DNA Double-Strand Breaks: Biological Effects and Relevance to Cancer Radiotherapy

簇状 DNA 双链断裂:生物学效应和癌症放疗相关性

Jac A. Nickoloff, Neelam Sharma and Lynn Taylor

https://www.mdpi.com/2073-4425/11/1/99

当前引用:71

文章亮点:

(1) 总结了辐射诱导的聚集性 DNA 损伤修复不良或无法修复是可以确定的。

(2) 与孤立病变相比,集群病变的致突变性和细胞毒性作用更大,且细胞毒性与放射性病变无关。

(3) 因为高线性能量转移 (Linear Energy Transfer, LET) 辐射会产生更多的聚集 DNA 损伤,因此每单位剂量的高 LET 带电粒子辐射的细胞毒性比低 LET 辐射更强。

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阅读英文原文。

05

Mutation Patterns of Human SARS-CoV-2 and Bat RaTG13 Coronavirus Genomes Are Strongly Biased Towards C>U Transitions, Indicating Rapid Evolution in Their Hosts

人类 SARS-CoV-2 和蝙蝠 RaTG13 冠状病毒基因组的突变模式强烈倾向于 C>U 转换,表明其宿主快速进化

Roman Matyášek and Aleš Kovařík

https://www.mdpi.com/2073-4425/11/7/761

当前引用:55

文章亮点:

(1) 分析了 34 种人类 SARS-CoV-2 分离株和中华菊头蝠中分离出的近缘 RaTG13 突变模式,其中 60% 可归因于 C > U 和 U > C 取代,远超过其他类型的取代作用。

(2) 比较蝙蝠 RaTG13 和 SARS-CoV-2,C > U 跃迁的数量是反向跃迁的近两倍,胞嘧啶 (C) 脱氨基导致的 C 到 U 转换在 SARS-CoV-2 冠状病毒的进化中发挥了重要作用。

(3) 研究推测高频 C > U 转换反映了宿主中病毒的适应过程,并且从动物传播到世界范围流行之前,SARS-CoV-2 可能已经在人类中发生了较长时间的进化。 

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阅读英文原文。

   Genes 期刊介绍

主编J. Peter W. Young, University of York, UK

期刊主题涵盖了与 DNA、RNA、染色体、基因、遗传学和多组学相关的所有内容。下设 18 个专题,从人类、动物、植物、微生物、分子遗传、种群进化和高新技术等多个角度全方位审视遗传学和基因组学的前沿研究。

2021 Impact Factor

4.141

2021 CiteScore

5.0

Time to First Decision

17.4 Days

Time to Publication

36 Days

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